Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPN11Q06124 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms