Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN1Q04323 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms