Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 CLDN17-201ENST00000286808 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 BNIP1-202ENST00000351486 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AC006333.1-204ENST00000429396 648 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AC022441.1-201ENST00000512599 794 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AC116345.1-202ENST00000513379 941 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 U91319.1-201ENST00000571619 764 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 SOX9-AS1-202ENST00000414600 742 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 AC012313.9-201ENST00000619318 633 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB1Q02641 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms