Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BEX3Q00994 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms