Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IFI35P80217 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFI35P80217 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFI35P80217 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFI35P80217 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFI35P80217 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFI35P80217 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFI35P80217 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFI35P80217 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFI35P80217 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFI35P80217 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFI35P80217 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFI35P80217 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFI35P80217 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFI35P80217 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFI35P80217 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFI35P80217 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFI35P80217 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFI35P80217 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFI35P80217 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFI35P80217 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFI35P80217 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFI35P80217 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFI35P80217 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFI35P80217 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFI35P80217 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFI35P80217 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFI35P80217 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFI35P80217 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFI35P80217 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFI35P80217 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFI35P80217 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFI35P80217 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFI35P80217 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFI35P80217 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFI35P80217 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFI35P80217 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFI35P80217 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFI35P80217 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFI35P80217 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFI35P80217 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFI35P80217 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IFI35P80217 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFI35P80217 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFI35P80217 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IFI35P80217 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFI35P80217 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFI35P80217 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFI35P80217 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFI35P80217 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFI35P80217 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFI35P80217 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFI35P80217 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFI35P80217 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFI35P80217 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFI35P80217 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFI35P80217 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFI35P80217 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFI35P80217 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFI35P80217 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFI35P80217 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFI35P80217 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFI35P80217 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFI35P80217 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFI35P80217 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IFI35P80217 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFI35P80217 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFI35P80217 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFI35P80217 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFI35P80217 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IFI35P80217 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFI35P80217 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFI35P80217 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IFI35P80217 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFI35P80217 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IFI35P80217 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFI35P80217 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFI35P80217 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFI35P80217 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFI35P80217 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFI35P80217 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFI35P80217 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFI35P80217 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFI35P80217 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFI35P80217 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFI35P80217 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IFI35P80217 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IFI35P80217 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IFI35P80217 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms