Protein–RNA interactions for Protein: P56524

HDAC4, Histone deacetylase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4P56524 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HDAC4P56524 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms