Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
THOP1P52888 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
THOP1P52888 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
THOP1P52888 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
THOP1P52888 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
THOP1P52888 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
THOP1P52888 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
THOP1P52888 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
THOP1P52888 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
THOP1P52888 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
THOP1P52888 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
THOP1P52888 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
THOP1P52888 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
THOP1P52888 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
THOP1P52888 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
THOP1P52888 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
THOP1P52888 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
THOP1P52888 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
THOP1P52888 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
THOP1P52888 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
THOP1P52888 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
THOP1P52888 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
THOP1P52888 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
THOP1P52888 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
THOP1P52888 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
THOP1P52888 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
THOP1P52888 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
THOP1P52888 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
THOP1P52888 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
THOP1P52888 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
THOP1P52888 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
THOP1P52888 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
THOP1P52888 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
THOP1P52888 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
THOP1P52888 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
THOP1P52888 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
THOP1P52888 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
THOP1P52888 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
THOP1P52888 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
THOP1P52888 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
THOP1P52888 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
THOP1P52888 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
THOP1P52888 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
THOP1P52888 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
THOP1P52888 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
THOP1P52888 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
THOP1P52888 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
THOP1P52888 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
THOP1P52888 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
THOP1P52888 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
THOP1P52888 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
THOP1P52888 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
THOP1P52888 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
THOP1P52888 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
THOP1P52888 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
THOP1P52888 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
THOP1P52888 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
THOP1P52888 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
THOP1P52888 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
THOP1P52888 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
THOP1P52888 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
THOP1P52888 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
THOP1P52888 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
THOP1P52888 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
THOP1P52888 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
THOP1P52888 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
THOP1P52888 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
THOP1P52888 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
THOP1P52888 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
THOP1P52888 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
THOP1P52888 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
THOP1P52888 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
THOP1P52888 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
THOP1P52888 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
THOP1P52888 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
THOP1P52888 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
THOP1P52888 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
THOP1P52888 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
THOP1P52888 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
THOP1P52888 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
THOP1P52888 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
THOP1P52888 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
THOP1P52888 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
THOP1P52888 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
THOP1P52888 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
THOP1P52888 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
THOP1P52888 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
THOP1P52888 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
THOP1P52888 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
THOP1P52888 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
THOP1P52888 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
THOP1P52888 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
THOP1P52888 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
THOP1P52888 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
THOP1P52888 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
THOP1P52888 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
THOP1P52888 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
THOP1P52888 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
THOP1P52888 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
THOP1P52888 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms