Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF6P49848 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF6P49848 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF6P49848 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TAF6P49848 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TAF6P49848 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TAF6P49848 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TAF6P49848 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TAF6P49848 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TAF6P49848 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TAF6P49848 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
TAF6P49848 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF6P49848 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF6P49848 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF6P49848 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF6P49848 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF6P49848 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF6P49848 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF6P49848 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF6P49848 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF6P49848 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF6P49848 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF6P49848 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF6P49848 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF6P49848 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF6P49848 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF6P49848 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF6P49848 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF6P49848 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF6P49848 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF6P49848 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF6P49848 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF6P49848 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF6P49848 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF6P49848 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF6P49848 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF6P49848 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF6P49848 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF6P49848 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF6P49848 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF6P49848 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF6P49848 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF6P49848 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF6P49848 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF6P49848 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF6P49848 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF6P49848 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF6P49848 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF6P49848 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF6P49848 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF6P49848 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF6P49848 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF6P49848 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF6P49848 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF6P49848 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF6P49848 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF6P49848 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF6P49848 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TAF6P49848 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF6P49848 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF6P49848 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF6P49848 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF6P49848 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF6P49848 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF6P49848 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF6P49848 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF6P49848 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF6P49848 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF6P49848 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF6P49848 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF6P49848 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF6P49848 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF6P49848 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF6P49848 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF6P49848 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF6P49848 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF6P49848 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF6P49848 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF6P49848 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF6P49848 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF6P49848 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF6P49848 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF6P49848 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF6P49848 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF6P49848 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF6P49848 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF6P49848 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF6P49848 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF6P49848 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF6P49848 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF6P49848 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF6P49848 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF6P49848 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF6P49848 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF6P49848 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF6P49848 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF6P49848 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF6P49848 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF6P49848 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TAF6P49848 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms