Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTPAP49638 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTPAP49638 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTPAP49638 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTPAP49638 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTPAP49638 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTPAP49638 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTPAP49638 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTPAP49638 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTPAP49638 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTPAP49638 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTPAP49638 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTPAP49638 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTPAP49638 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTPAP49638 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TTPAP49638 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTPAP49638 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTPAP49638 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTPAP49638 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTPAP49638 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTPAP49638 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTPAP49638 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTPAP49638 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTPAP49638 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TTPAP49638 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTPAP49638 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTPAP49638 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTPAP49638 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTPAP49638 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTPAP49638 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTPAP49638 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TTPAP49638 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTPAP49638 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTPAP49638 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TTPAP49638 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTPAP49638 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTPAP49638 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTPAP49638 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTPAP49638 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTPAP49638 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTPAP49638 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTPAP49638 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTPAP49638 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTPAP49638 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTPAP49638 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTPAP49638 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTPAP49638 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTPAP49638 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTPAP49638 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTPAP49638 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TTPAP49638 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTPAP49638 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTPAP49638 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTPAP49638 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTPAP49638 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTPAP49638 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TTPAP49638 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TTPAP49638 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms