Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RANGAP1P46060 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms