Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTPRDP23468 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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