Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SPI1P17947 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SPI1P17947 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPI1P17947 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPI1P17947 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPI1P17947 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPI1P17947 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPI1P17947 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPI1P17947 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPI1P17947 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPI1P17947 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SPI1P17947 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SPI1P17947 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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