Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMC1P11047 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms