Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EDIL3O43854 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms