Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC169A6NNP5 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC169A6NNP5 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms