Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAK1Q9UPV9 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms