Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SETD1BQ9UPS6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SETD1BQ9UPS6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms