Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
POLKQ9UBT6 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLKQ9UBT6 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms