Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC6A20Q9NP91 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms