Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms