Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CLMPQ9H6B4 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLMPQ9H6B4 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms