Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SLIRPQ9GZT3 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms