Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 LCMT1-AS1-202ENST00000563962 766 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 AC026304.1-201ENST00000597953 561 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 AL662797.3-201ENST00000607476 773 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM69A-204ENST00000615519 865 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 AC008993.3-201ENST00000633603 631 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 LANCL1-201ENST00000233714 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 PSG5-201ENST00000342951 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 AC087203.3-201ENST00000602981 1547 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 CYB5B-204ENST00000515314 1658 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 CREBRF-203ENST00000520420 1660 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 MMP27-201ENST00000260229 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 TP53TG3F-201ENST00000617705 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 LIN52-205ENST00000555028 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 SCGB2A2-201ENST00000227918 505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 THRSP-201ENST00000281030 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 KRTAP11-1-201ENST00000332378 912 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 POP5-201ENST00000341039 913 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 KRTAP4-9-201ENST00000391415 1157 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 HNRNPA1P37-201ENST00000404243 969 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 AL772337.2-201ENST00000411992 981 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 TP53-203ENST00000413465 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
KRTAP9-9Q9BYP9 ZBTB20-AS4-201ENST00000472323 675 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms