Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SCAPERQ9BY12 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCAPERQ9BY12 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms