Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF17Q9BXT8 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF17Q9BXT8 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms