Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTKNQ9BST9 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms