Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
APOBEC4Q8WW27 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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