Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5D8

NANOGNB, NANOG neighbor homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGNBQ7Z5D8 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NANOGNBQ7Z5D8 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NANOGNBQ7Z5D8 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NANOGNBQ7Z5D8 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NANOGNBQ7Z5D8 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NANOGNBQ7Z5D8 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NANOGNBQ7Z5D8 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NANOGNBQ7Z5D8 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NANOGNBQ7Z5D8 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NANOGNBQ7Z5D8 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NANOGNBQ7Z5D8 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NANOGNBQ7Z5D8 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NANOGNBQ7Z5D8 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NANOGNBQ7Z5D8 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NANOGNBQ7Z5D8 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NANOGNBQ7Z5D8 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NANOGNBQ7Z5D8 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NANOGNBQ7Z5D8 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NANOGNBQ7Z5D8 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NANOGNBQ7Z5D8 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NANOGNBQ7Z5D8 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NANOGNBQ7Z5D8 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NANOGNBQ7Z5D8 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NANOGNBQ7Z5D8 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NANOGNBQ7Z5D8 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NANOGNBQ7Z5D8 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NANOGNBQ7Z5D8 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NANOGNBQ7Z5D8 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NANOGNBQ7Z5D8 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NANOGNBQ7Z5D8 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NANOGNBQ7Z5D8 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NANOGNBQ7Z5D8 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NANOGNBQ7Z5D8 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NANOGNBQ7Z5D8 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NANOGNBQ7Z5D8 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NANOGNBQ7Z5D8 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NANOGNBQ7Z5D8 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NANOGNBQ7Z5D8 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NANOGNBQ7Z5D8 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NANOGNBQ7Z5D8 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NANOGNBQ7Z5D8 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NANOGNBQ7Z5D8 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NANOGNBQ7Z5D8 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NANOGNBQ7Z5D8 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NANOGNBQ7Z5D8 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NANOGNBQ7Z5D8 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NANOGNBQ7Z5D8 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NANOGNBQ7Z5D8 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NANOGNBQ7Z5D8 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms