Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CARMIL2Q6F5E8 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms