Protein–RNA interactions for Protein: Q5BLP8

C4orf48, Neuropeptide-like protein C4orf48, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48Q5BLP8 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 MYOCOS-204ENST00000637642 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC004158.1-202ENST00000624327 1645 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 VSIG1-201ENST00000217957 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 LINC01066-201ENST00000415283 399 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AL441943.1-201ENST00000435539 432 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 LINC01823-204ENST00000438722 794 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC073911.1-202ENST00000443154 1151 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 NACAP1-202ENST00000519039 641 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 SUPT16H-204ENST00000555943 915 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC025430.1-201ENST00000561324 498 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC092368.2-201ENST00000565911 600 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 LINC02152-201ENST00000566208 1281 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 EXOC8-201ENST00000366645 5100 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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C4orf48Q5BLP8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 TMEM19-204ENST00000549735 1772 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 MPP4-207ENST00000428900 2320 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
C4orf48Q5BLP8 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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