Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF2Q5BJF6 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms