Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P3H1Q32P28 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms