Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GRIK5Q16478 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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