Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SMC1AQ14683 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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