Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CUL3Q13618 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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