Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP3Q12983 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms