Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RBBP4Q09028 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms