Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
KRTAP1-1Q07627 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
KRTAP1-1Q07627 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms