Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GTF2BQ00403 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GTF2BQ00403 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.8 ms