Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TUBA4AP68366 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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