Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2BFSP57053 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms