Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK1EP49674 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1EP49674 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1EP49674 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1EP49674 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1EP49674 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK1EP49674 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms