Protein–RNA interactions for Protein: P49411

TUFM, Elongation factor Tu, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFMP49411 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUFMP49411 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUFMP49411 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUFMP49411 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUFMP49411 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUFMP49411 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUFMP49411 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUFMP49411 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUFMP49411 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUFMP49411 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUFMP49411 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUFMP49411 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUFMP49411 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUFMP49411 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUFMP49411 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUFMP49411 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUFMP49411 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUFMP49411 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TUFMP49411 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUFMP49411 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUFMP49411 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUFMP49411 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUFMP49411 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUFMP49411 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUFMP49411 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUFMP49411 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUFMP49411 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUFMP49411 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUFMP49411 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUFMP49411 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TUFMP49411 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUFMP49411 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUFMP49411 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUFMP49411 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUFMP49411 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUFMP49411 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUFMP49411 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUFMP49411 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TUFMP49411 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TUFMP49411 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TUFMP49411 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TUFMP49411 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TUFMP49411 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TUFMP49411 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TUFMP49411 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TUFMP49411 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TUFMP49411 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TUFMP49411 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUFMP49411 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUFMP49411 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUFMP49411 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUFMP49411 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUFMP49411 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUFMP49411 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUFMP49411 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUFMP49411 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUFMP49411 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUFMP49411 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUFMP49411 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUFMP49411 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUFMP49411 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUFMP49411 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUFMP49411 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUFMP49411 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUFMP49411 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TUFMP49411 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUFMP49411 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUFMP49411 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUFMP49411 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUFMP49411 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TUFMP49411 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUFMP49411 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUFMP49411 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TUFMP49411 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUFMP49411 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUFMP49411 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUFMP49411 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUFMP49411 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUFMP49411 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUFMP49411 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUFMP49411 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUFMP49411 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUFMP49411 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUFMP49411 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUFMP49411 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUFMP49411 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUFMP49411 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUFMP49411 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUFMP49411 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUFMP49411 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUFMP49411 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUFMP49411 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TUFMP49411 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TUFMP49411 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms