Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA7P31268 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms