Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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PTPRAP18433 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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PTPRAP18433 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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PTPRAP18433 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRAP18433 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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