Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COL6A2P12110 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms