Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI2P10070 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI2P10070 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI2P10070 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI2P10070 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI2P10070 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI2P10070 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI2P10070 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI2P10070 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI2P10070 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI2P10070 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI2P10070 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI2P10070 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI2P10070 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI2P10070 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI2P10070 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI2P10070 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI2P10070 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI2P10070 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI2P10070 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI2P10070 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GLI2P10070 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GLI2P10070 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GLI2P10070 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GLI2P10070 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GLI2P10070 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GLI2P10070 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GLI2P10070 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GLI2P10070 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GLI2P10070 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GLI2P10070 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GLI2P10070 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GLI2P10070 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GLI2P10070 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GLI2P10070 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GLI2P10070 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GLI2P10070 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GLI2P10070 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GLI2P10070 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GLI2P10070 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI2P10070 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI2P10070 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI2P10070 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI2P10070 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI2P10070 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI2P10070 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI2P10070 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI2P10070 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI2P10070 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI2P10070 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI2P10070 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI2P10070 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI2P10070 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI2P10070 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI2P10070 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI2P10070 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI2P10070 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI2P10070 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI2P10070 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI2P10070 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI2P10070 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI2P10070 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI2P10070 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI2P10070 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI2P10070 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI2P10070 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI2P10070 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI2P10070 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI2P10070 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI2P10070 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI2P10070 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI2P10070 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI2P10070 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI2P10070 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI2P10070 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI2P10070 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI2P10070 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI2P10070 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI2P10070 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI2P10070 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI2P10070 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI2P10070 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI2P10070 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI2P10070 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI2P10070 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI2P10070 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI2P10070 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI2P10070 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI2P10070 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI2P10070 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI2P10070 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI2P10070 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI2P10070 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI2P10070 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI2P10070 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI2P10070 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI2P10070 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI2P10070 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI2P10070 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI2P10070 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms