Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GIMD1P0DJR0 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms