Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APODP05090 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APODP05090 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APODP05090 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APODP05090 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APODP05090 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APODP05090 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APODP05090 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APODP05090 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APODP05090 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APODP05090 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APODP05090 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APODP05090 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APODP05090 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APODP05090 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APODP05090 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APODP05090 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APODP05090 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APODP05090 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APODP05090 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APODP05090 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APODP05090 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APODP05090 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APODP05090 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APODP05090 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APODP05090 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APODP05090 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APODP05090 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APODP05090 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APODP05090 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APODP05090 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APODP05090 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APODP05090 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APODP05090 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APODP05090 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APODP05090 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APODP05090 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APODP05090 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APODP05090 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APODP05090 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APODP05090 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APODP05090 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APODP05090 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APODP05090 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APODP05090 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APODP05090 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APODP05090 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APODP05090 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APODP05090 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APODP05090 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APODP05090 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APODP05090 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APODP05090 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APODP05090 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APODP05090 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APODP05090 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APODP05090 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APODP05090 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APODP05090 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APODP05090 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APODP05090 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APODP05090 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APODP05090 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APODP05090 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APODP05090 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APODP05090 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APODP05090 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APODP05090 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APODP05090 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APODP05090 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APODP05090 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APODP05090 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APODP05090 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APODP05090 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APODP05090 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APODP05090 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APODP05090 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APODP05090 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APODP05090 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APODP05090 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APODP05090 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APODP05090 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APODP05090 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APODP05090 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APODP05090 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APODP05090 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APODP05090 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APODP05090 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APODP05090 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APODP05090 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APODP05090 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APODP05090 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APODP05090 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APODP05090 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APODP05090 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APODP05090 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APODP05090 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APODP05090 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APODP05090 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APODP05090 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms