Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PF4P02776 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PF4P02776 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PF4P02776 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PF4P02776 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PF4P02776 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PF4P02776 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
PF4P02776 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PF4P02776 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
PF4P02776 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
PF4P02776 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PF4P02776 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PF4P02776 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PF4P02776 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PF4P02776 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PF4P02776 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PF4P02776 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PF4P02776 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PF4P02776 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PF4P02776 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PF4P02776 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PF4P02776 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PF4P02776 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PF4P02776 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PF4P02776 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PF4P02776 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PF4P02776 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PF4P02776 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 UGT1A10-202ENST00000373445 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PF4P02776 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PF4P02776 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PF4P02776 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PF4P02776 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PF4P02776 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PF4P02776 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PF4P02776 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PF4P02776 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PF4P02776 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PF4P02776 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PF4P02776 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PF4P02776 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PF4P02776 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PF4P02776 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms